积极治台时期[编辑]
参见：牡丹社事件、开山抚番、刘璈及刘铭传
亿载金城，为1875年沈葆桢延请法国工程师设计建造，建筑仿巴黎要塞。
清廷对台湾的消极态度一直要到19世纪中叶才改变，其原因是由於国际环境的改变。第一次鸦片战争後，欧洲势力冲击着清帝国统治下的台湾。第二次鸦片战争後，清政府同意让台湾开港通商（安平、淡水），不久又开放打狗（今高雄港）和J笼（今基隆港）二港。此後，台湾的对外贸易相当热络，台湾盛产的茶、蔗糖和樟脑大量出口，这增加了就业机会与政府税收，一些新的城市也纷纷兴起；同时也导致原住民族被迫东迁、客家人地位上升、买办兴起与水土环境被破坏等社会和环境影响。
西方文化伴随着台湾开港再次传入台湾。在西方各教派中，以基督教的长老教会影响为最大，着名的来台传教士有马雅各、马偕、甘为霖、巴克礼等。
同时，各国的势力也纷纷进入台湾，1867年（同治六年），发生了罗发号事件，十几名美国船员在恒春一带被原住民族杀害。
最後美国驻厦门领事李仙得与恒春半岛十八社首领签订了《船难救助条约》，这等於否定了清政府在番地的管辖权，为其後大日本帝国出兵台湾提供了理由。
1871年，54名琉球人因台风而漂流到恒春半岛，被原住民族所杀。
日本派代表要求清政府处理，而清政府以「生番系我化外之民」为由拒绝，结果在1874年（同治十三年），大日本帝国派兵攻打台湾南部牡丹社的原住民，是为牡丹社事件。之後清政府照会日方，要求日本撤军，并承认此行动乃「保民义举」，日方认为这等於放弃对琉球王国的宗主权，而清廷则认为「保民义举」是指日方提出的受害渔民中有4人为小田县人。（实际上自从1609年日本出兵琉球之後，琉球王国就同时向中国明朝和日本萨摩藩双方朝贡，已逐渐形成两属状态。）同时自此以後，为因应国际局势的变化，清政府於是积极拟定经营台湾的方针。1884年10月，中法战争时，法国海军将领孤拔也曾占领基隆，进攻淡水，并下令封锁台湾。
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